问题：在Linux系统下已经设置只读文件的权限为什么文件还是被修改？

原因：这种情况一般来说是黑客利用了php中的chmod函数进行修改权限最后修改文件。

解决办法：

步骤1：控制面板—切换php版本为php5.3/5.4/5.5

步骤2：从文件管理中进入others目录修改php.ini文件，在disable_functions设置中 禁止 添加chmod  这个功能。